Cả hai dạng bào tử và sinh dưỡng của các loài Bacillus đều được sử dụng làm chế phẩm sinh học và chúng có tính ổn định cao đối với các điều kiện khí quyển xung quanh như nhiệt độ, điều kiện dạ dày và độ ẩm. Các chủng lợi khuẩn Bacillus thương mại đang được sử dụng là B. cereus, B. clausii, B. coagulans, B. licheniformis, B. polyfermenticus, B. pumilus và B. subtilis. Các chủng này có đặc tính kháng khuẩn, chống ung thư, chống oxy hóa và sản xuất vitamin. Tuy nhiên, men vi sinh Bacillus cũng có thể tạo ra độc tố và amin sinh học và chuyển gen kháng thuốc kháng sinh; do đó, sự an toàn của họ là một mối quan tâm. Các nghiên cứu về hệ vi sinh vật sử dụng các chủng Bacillus probiotic còn hạn chế ở người. Hầu hết các nghiên cứu về hệ vi sinh vật đã được thực hiện ở gà, chuột và lợn. Một số chế phẩm sinh học Bacillus được sử dụng làm chất khởi động quá trình lên men trong thực vật và đậu tương và bổ sung chế độ ăn uống của thực phẩm nướng như một chất mang probiotic. Bài tổng quan này tóm tắt đặc điểm của các loài Bacillus là chế phẩm sinh học dùng cho người và tính an toàn, hệ vi sinh vật và chất mang lợi khuẩn của chúng.